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La Mer Egée méridionale a assisté, en 1630 av. J.-C., au tsunami le plus grand jamais vu dans l’histoire humaine à cause de sa taille importante et son possible impact sur les civilisations de l’Age du Bronze Final comme la civilisation minoenne de l’île de Crète. Il a été provoqué par l’éruption et l’effondrement du volcan de l’île de Santorin.

Selon la recherche “Evaluation de l'aléa tsunami dans le nord de la mer Egée” de l’Institut de Géosciences Appliquées de l’Université des Technologies de Berlin, si on considère les témoignages historiques sur les tsunamis dans les littoraux turcs et grecs, il y a un élevé potentiel de génération de tsunami dans les alentours de la Mer Egée. Les chercheurs ont identifié et cartographié les zones côtières égéennes de la Turquie et de la Grèce qui pourraient être sujettes aux inondations dans l’éventualité d’un tsunamis catastrophique. Les images satellitaires, les données du Modèle Numérique d'Elévation - DEM (Digital Elevation Model) et une base de données SIG ont été utilisées pour indiquer les zones sensibles qui demandent une planification d’urgence adéquate pour les tsunamis.

La recherche a étudié aussi l’impact et la destructivité d’un potentiel tsunami dans les côtes turques et grecques par rapport aux paramètres suivants : a) largeur de la plaque continentale; b) bathymétrie du littoral; c) effets d’une intensité élevée d’énergie; d) topographie côtière; e) rapidité terminale du tsunami et hausse de la taille; f) type d’aménagement du territoire dans la côte affectée- y compris la densité de végétation et des bâtiments.

Le dernier grand tsunami en Méditerranée est survenu dans les îles Cyclades en Mer Egée méridionale le 9 juillet 1956 après un tremblement de terre de magnitude 7,4. La source qu’il a généré était près de Santorin. Un glissement de terrain sous-marin a probablement été le mécanisme déclencheur du tsunami. Des dégâts considérables ont été enregistrés dans les structures portuaires de la zone, dans des grands et petits vaisseaux, dans les terres cultivées et les propriétés, et au moins quatre personnes se sont noyées.

Un autre grand tsunami a été provoqué en mer Egée dans le mois de septembre 1650 pendant l’éruption du Kolumbo, un volcan sous-marin au nord-est de île de Santorin. L’activité volcanique commença le 26 septembre. Pendant une pause d’activité, la mer s’est soulevée, a encerclé l’île et les vagues ont inondé la côte orientale et a emporté des églises, les enceintes, les bateaux, les arbres et les terres cultivées. Dans les côtes orientale et occidentale des îles de Patmos et dans la côte d’Ios, le tsunami a rejoint respectivement les 30 m, les 50 m et les 16 m. Les navires et les bateaux de pêche amarrés à Héracleion, au nord de Crète, furent projetés violemment sur la côte alors que les vaisseaux furent détruits lorsque la vague rejoignit les murs de la ville. Le calme volcanique et séismique qui a précédé le tsunami indique qu’il a été provoqué par des glissements de terrain sous-marins ou par l’écroulement du cône volcanique plutôt que par un fort tremblement de terre ou par une explosion volcanique.

L'étude de l’Université des Technologies de Berlin souhaitait aussi représenter une base pour un futur système d’alerte tsunami et fournir aux gouvernements locaux les recommandations sur les activités de réduction du risque de catastrophe.